El fracàs del Quart Nen ha suposat un cop dur per a la NERV i tots els que hi confien per protegir la ciutat, i tota la humanitat, de l'atac d'aquests éssers monstruosos. Però en Kaji va descobrint que els atacs dels Àngels no són tan aleatoris o indiscriminats com sembla, sinó que el que de veritat pretenen es dur a terme una operació de rescat...